מרדכי בכר נולד באיסטנבול תורכיה ב1927 למשפחה במעמד כלכלי בינוני. היה לו אח בוגר ממנו. הוא דובר תורכית, לדינו, וצרפתית. כנער השתתף במפגשים סודיים של הסוכנות היהודית, בהם בין היתר למד עברית. במפגשים אלו פגש את בת זוגתו לעתיד – ציפורה.
בגיל 16 עלה על רכבת יחד עם עוד נערים תורכיים והגיעו עד לגבול הסורי. מסוריה עברו ללבנון. שם, הוא מספר, שיום אחד קפץ לים וכמעט טבע, ולמזלו צרפתי אחד הציל אותו. מלבנון עברו הנערים לראש הניקרה ובשנת 1940, אחרי מחנה עולים בבת גלים שבחיפה הוא, ציפורה ושאר הנערים עברו לקיבוץ גבולות.
בשנת 1964 מרדכי, ציפורה והמשפחה עברו להעוגן. מרדכי נקלט לעבודה במפעל ועבד שם עד שיצא לפנסיה.
למרדכי וציפור שלושה ילדים, אירית, שנשואה ליואב פואה, איתי שנשוי לטליה, ורוני שנשואה ליהודה פורגס. למרדכי כ-15 נכדים, כ-35 נינים.
